对样本进行酶解，TiO2或IMAC富集磷酸化肽段，5600-plus质谱检测，利用得到的质谱谱图与数据库搜索比较，从而得到肽段序列结果，计算出磷酸化位点。磷酸化蛋白选择iTRAQ定量或SWATH定量

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非标记定量技术（Label Free）用来比较的样品不经过任何标记，直接酶解后经过质谱分析产生数据。Label Free技术减少了前处理过程中的样品损失，在肽段的检测和蛋白质覆盖率方面具有优势；

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1）普通线性肽，链长至189个氨基酸，毫克至克级，纯度可达99%2）简单修饰肽：免费提供N端乙酰化，末端酰胺化3）复杂修饰肽：脂肽，磷酸肽（Ser、Thr、Tyr），环肽（酰胺环、二硫键环），荧光标记肽（FAM、FITC），生物素标记肽（BIOTIN）、复合抗原肽（MAP）等 4）蛋白偶

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iTRAQ/TMT蛋白组定量分析 SILAC蛋白组定量分析  Label Free非标定量分析  半定量分析（spectral count）    鸟枪法蛋白全谱分析  2D蛋白胶点鉴定   单一蛋白高覆盖度分析

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