细菌基因组测序
新一代高通量测序技术大大减少了基因组测序的成本和时间，让更多实验室可以开展微生物基因组测序项目。根据不同的研究目的和测序要求，细菌基因组测序可分为四种类型：细菌基因组Scanning、细菌基因组
酶切建库测序
RAD（restriction site associated DNA）是与限制性核酸内切酶识别位点相关的DNA。RAD-Seq是对酶切获得的标签进行高通量测序，大幅降低基因组的复杂度，操作简便。
基因表达谱分析
基因表达谱分析直接对某一物种或特定细胞在某一功能状态下产生的mRNA进行高通量测序，研究基因的表达差异情况。与转录组测序相比，基因表达谱测序要求的读长更短，测序通量更小，仅可用于基因表达差异的研究。
hMeDIP测序
云序生物提供的(h)MeDIP测序服务，将(羟)甲基化DNA免疫共沉淀技术（(h)MeDIP）和高通量测序相结合，能够帮助客户快速地获得全基因组DNA(羟)甲基化图谱，并比较不同样品中的分布差异。
small RNA测序服务（illumina solexa高通量测序）
使用美国Illumina公司根据最新的测序技术研制而成的Solexa测序仪，该技术目前可在每一张芯片获取50G 的碱基数据，超过传统Megabace 测序仪近千倍的工作量，并大大降低了成本。
全外显子测序
全外显子组测序WES（Whole Exome Sequencing）是指利用序列捕获或者靶向技术将全基因组外显子区域 DNA 富集后再进行高通量测序的基因组分析方法。